Новые варианты коронавируса быстро распространяются — теперь мы можем обнаружить их раньше
|
Это актуально, например, для оценки того, насколько опасен коронавирус в настоящее время и как быстро он распространяется, например, в странах, где люди проводят отпуск.
Выявить потенциальный риск различных вариантов коронавируса на три месяца раньше
В будущем это может произойти гораздо быстрее, чем раньше. Исследователи под руководством Элис Макхарди, заведующей отделом биоинформатики для исследований инфекций в Центре исследований инфекций имени Гельмгольца в Брауншвейге, хотят в некоторых аспектах опередить ВОЗ.
Как сообщается в недавнем
Классификация ВОЗ по коронавирусу
VUM, варианты под наблюдением: Эти варианты
VOI, варианты, представляющие интерес: Эти варианты вируса представляют риск для мирового общественного здравоохранения.
ЛОС (варианты, вызывающие опасения): Эти варианты особенно заразны и вызывают тяжёлые заболевания. Вакцины в таких случаях могут быть менее эффективны.
Кроме того, платформа геномного надзора за вирусом
Команда Макхарди продемонстрировала это в комплексном анализе, опубликованном в журнале «Nature Communications». Раннее обнаружение ЛОС особенно важно для разработки вакцины, поскольку оно обеспечивает защиту от новых вариантов вируса.
Как работает прогноз варианта коронавируса
В частности, используется матрица, основанная на наблюдениях за долгосрочной эволюцией некоторых вирусов гриппа.
Исследователи в первую очередь изучают изменения в специфическом белке
вируса, так называемом
Система CoVerage использует соответствующие данные из базы данных геномов
вирусов GISAID, инициативы по обмену данными о распространённых патогенах,
таких как грипп,
Используя статистический метод, учёные определяют, какие штаммы вируса
значительно изменили способность вируса ускользать от иммунного ответа. Для
этого они сравнивают изменения
